Город Махачкала, в котором расположен офис заповедника "Дагестанский", является столицей Дагестана. Махачкала имеет железнодорожное сообщение с городами Москва, Ростов-на-Дону, Волгоград, Астрахань, Баку и др. Есть международный аэропорт Уйташ (на окраине г. Каспийск, в получасе езды по современной автомагистрали от г. Махачкалы), который принимает самолеты из Москвы, С-Петербурга, Минеральных Вод и других городов России, стран ближнего и дальнего зарубежья. Имеется два автовокзала (один на въезде с севера, второй на въезде с юга), откуда совершаются рейсы во все города, поселки и районные центры Дагестана, а также в Москву, Санкт-Петербург, Баку, Ставрополь, Владикавказ, Краснодар, Ростов-на-Дону, Элисту, Волгоград и другие города. В Махачкале есть морской порт, через который в перспективе возможны круизы по Каспию.
Участок «Кизлярский залив»
Наиболее удобным населенным пунктом для доступа к Кизлярскому заливу является поселок Кочубей Тарумовского района Дагестана. Этот населенный пункт находится на пересечении автомобильных трасс Махачкала – Астрахань и Кочубей-Буденовск. Сюда можно добраться на любом проходящем автобусе или маршрутном такси из г.Махачкалы (206 км) или г.Кизляра (60 км), а также городов и поселков соседних республик (Ставрополь, Элиста, Волгоград, Ростов-на-Дону, Краснодар и др.). Недалеко от поселка имеется железнодорожная станция, где останавливаются пассажирские поезда Махачкала-Москва, Махачкала-Астрахань, Баку-Ростов и др. В поселке имеются гостиницы и множество объектов инфракструктуры.
От Кочубея до кордонов участка «Кизлярский залив» заповедника «Дагестанский» можно добраться на автотранспорте, до разъездов № 14 и 12, и далее по проселочным дорогам до берега.
Участок «Сарыкумские барханы»
Самым близким к участку заповедника населенным пунктом является поселок Коркмаскала. От Махачкалы участок удален примерно на 18 км. До окраины Коркмаскалы, на пересечение шоссе Ростов - Баку с железной дорогой Шамхал-Буйнакск можно добраться на любом проходящем автобусе или маршрутном такси. Отсюда, вдоль левого берега реки Шура-Озень, идет грунтовая дорога на бывшую железнодорожную станцию «Кумторкала», где в настоящее время расположен кордон заповедника. Также, можно проехать вдоль правого берега реки по асфальтовой дороге до развалин селения Кумторкала и далее вброд через русло реки. Следует помнить о возможности паводков на реке.
Аграханский заказник
С северо-западной стороны заказник граничит с единственным населенным пунктом – селом Старотеречное Кизлярского района. До него можно добраться на автобусе или маршрутном такси из Махачкалы (расстояние - 120 км) или Кизляра. Далее на транспорте сотрудников заповедника можно попасть на кордон Чаканный, где есть хорошие условия для приема посетителей. Также можно проехать вдоль берега Каспийского моря, через мост на р.Терек, на север Аграханского полуострова вплоть до остатков населенного пункта Лопатин.
Самурский заказник
На территории заказника расположено несколько населенных пунктов (Азадоглы, Самур, Тагиркент-Казмаляр, Приморский и др.) до которых из Махачкалы можно добраться как автомобильным, так и железнодорожным транспортом. С южной автостанции г.Махачкалы и из г.Дербента в села Самур, Тагиркент, Хтун, Бильбиль и Приморский следуют маршрутные такси (расстояние от Махачкалы 250 км).
Тляратинский заказник
Из Махачкалы в районный центр Тляратинского района (Тлярата) можно добраться маршрутным такси (200 км), следует помнить, о том что район пограничный и при его посещении необходимо иметь при себе паспорт. Далее в населенные пункты, расположенные на территории заказника можно попасть на маршрутных такси из Тляраты, на транспорте сотрудников заповедника или на попутном транспорте.